Для осуществления основных видов деятельности филиала, предусмотренных Положением о Северо-Восточном бассейновом филиале ФГУП «Росморпорт», а также предоставления услуг судовладельцам на подходах и в акваториях морских портов Анадырь, Ванино, Де-Кастри, Магадан, Николаевск-на-Амуре и Советская Гавань, филиал располагает судами служебно-вспомогательного флота различного назначения.
По состоянию на 01.01.2026 за Северо-Восточным бассейновым филиалом закреплено 17 судов.
Структура флота филиала по функциональному назначению судов имеет следующий вид:
- портовые и рейдовые буксиры – 7 судов;
- служебно-разъездные и патрульные суда – 5 судов;
- суда природоохранного назначения – 4 судна;
- транспортные и грузопассажирские суда – 1 судно.
