Приказом Министерства транспорта Российской Федерации от 01.03.2011 № 65 внесены изменения в приказ Минтранса России от 17.12.2007 № 189, связанные с корректировкой перечня портовых сборов, взимаемых в морских портах Российской Федерации. В соответствии с внесенными изменениями:
  - в морском порту Мезень взимаются корабельный, лоцманский, маячный сборы;
  - в морском порту Онега взимаются корабельный, канальный, лоцманский, маячный, навигационный сборы;
  - в морском порту Николаевск-на-Амуре взимаются корабельный, лоцманский, маячный, навигационный сборы, а также в связи с тем, что перегрузочный комплекс Мыс Лазарева является самостоятельным морским портом, исключены портовые сборы, взимаемые на перегрузочном комплексе Мыс Лазарева морского порта Николаевск-на-Амуре;
  - в морском порту Холмск взимаются корабельный, лоцманский, маячный, навигационный сборы.