Лоцманская служба
- Диспетчерский отдел
Служба флота
- Группа механиков-наставников
- Отдел учёта и планирования работы флота
- Отдел использования топливно-смазочных ресурсов
- Агентский отдел
Плавсостав
Служба связи и электрорадионавигации
- Отдел технической эксплуатации радиоэлектронных средств и радионавигационных систем
- Отдел глобальной морской системы связи при бедствии (ГМССБ)
- Отдел сетей связи, систем коммутации и оповещения
- Отдел Региональной информационной системы наблюдения за судоходством на Северо-Западе, локальных вычислительных сетей и баз данных региональной системы безопасности мореплавания
- Отдел оформления и учёта радиоэлектронных средств
- Отдел энергетического и хозяйственного обеспечения
- Отдел технической эксплуатации системы управления движением судов
- Отдел технической эксплуатации систем наблюдения и оповещения;
Региональная служба управления движением судов (РСУДС)
- СУДС Санкт-Петербург
• Субцентр Санкт-Петербург
- Оперативно-технический отдел
• Оперативная группа Центра «Раскат»
• Оперативная группа СУДС Высоцк
• Оперативная группа СУДС Приморск
• Оперативная группа СУДС Усть-Луга
• Оперативная группа Субцентра
- Портовая СУДС Высоцк
- Портовая СУДС Приморск
- Портовая СУДС Усть-Луга
Отдел технического наблюдения за акваторией
Группа наставников
Служба капитального строительства и ремонта
- Отдел капитального строительства и ремонта
- Технический отдел
Сметно-аналитический отдел
Отдел эксплуатации и развития морских путей
Служба морских путей
- Отдел навигационной обстановки
- Группа контроля глубин
Отдел главного энергетика
Служба экологической безопасности
- Отдел охраны окружающей среды
Бухгалтерия
Планово-экономический отдел
Финансовый отдел
Отдел инвестиционных проектов
Юридический отдел
Отдел по управлению государственным имуществом
Отдел по страхованию и претензионной работе
Отдел закупок
Общий отдел
Служба безопасности
- Отдел экономической безопасности
- Отдел транспортной безопасности и обеспечения охраны
• Сектор безопасности на о. Сескар
• Сектор безопасности на о. Гогланд
• Группа безопасности по порту Выборг-Высоцк
• Группа безопасности по порту Усть-Луга
Отдел по защите информации и технической защите
Режимно-секретный отдел
Служба мобилизационной подготовки
- Сектор мобилизационной подготовки
- Сектор по гражданской обороне
- Загородный склад в порту Усть-Луга
Отдел по работе с персоналом и кадровому делопроизводству
Отдел труда, заработной платы и штатов
Отдел охраны труда
Сектор по пожарной безопасности
Центр технической поддержки
- Отдел программного обеспечения
- Отдел системного администрирования
Отдел внешних связей
Служба эксплуатации автотранспорта
Административно-хозяйственный отдел
- Группа хозяйственного обеспечения
- Группа ремонта помещений
- Группа снабжения
Канцелярия
Выборгско-Высоцкое управление Северо-Западного бассейнового филиала
Руководство
- Аппарат управления
Лоцманская служба
Отдел капитального строительства и ремонта
Группа транспортного обеспечения
Группа морских путей и экологии в портах Выборг-Высоцк
Отдел навигационной обстановки
Отдел связи и электрорадионавигации
Отдел по управлению и эксплуатации флота
- Плавсостав
Группа транспортной безопасности и обеспечения охраны
Калининградское управление Северо-Западного бассейнового филиала
Руководство
Лоцманская служба
Отдел технического наблюдения за акваторией
Служба управления движением судов (СУДС)
- Центральный пост СУДС (Балтийск)
Служба морского канала
- Группа по ремонту и обслуживанию навигационного оборудования
- Группа контроля глубин
Служба эксплуатации железнодорожного паромного комплекса
- Стивидорная группа
- Грузовой склад
- Коносаментная группа
- Группа железнодорожных операций
- Группа эксплуатации подъёмно-переходного моста
- Ремонтная группа комплекса
- Группа по обслуживанию очистных сооружений и котельной
- Группа хозяйственного обеспечения
Коммерческий отдел
Дирекция по строительству международного терминала для приема круизных и грузопассажирских судов
- группа инспекции технического надзора
- планово-сметная группа
- производственно-техническая группа
Отдел капитального строительства
Сектор проектно-сметных работ
Отдел технической эксплуатации и ремонта портовых сооружений
Отдел технической эксплуатации флота
- Плавсостав
Группа наставников
Сектор по охране окружающей среды
Отдел главного энергетика
Служба связи и электрорадионавигации
- Отдел связи
- Отдел ГМССБ
- Отдел технического обеспечения СУДС
Отдел информационных систем и программного обеспечения
Бухгалтерия
- Группа по учёту хозяйственных операций
Планово-экономический отдел
Отдел по управлению государственным имуществом
Отдел закупок
Юридический отдел
Охрана труда
Сектор мобилизационной подготовки и гражданской обороны
Режимно-секретное подразделение
Сектор по пожарной безопасности
Отдел транспортной безопасности и обеспечения охраны
Группа технической защиты
Отдел по работе с персоналом и административным вопросам
- Сектор транспорта
- Сектор хозяйственного обеспечения
- Канцелярия
- Диспетчерская
Усть-Лужское управление Северо-Западного бассейнового филиала
Руководство
- Аппарат управления
Лоцманская служба
- Диспетчерский отдел
Отдел капитального строительства и ремонта
Отдел технического обеспечения
Отдел морских путей и экологии
Промерная группа
Отдел навигационной обстановки
Отдел главного энергетика
Группа транспортного обеспечения
Отдел связи и электрорадионавигации
Плавсостав
Служба эксплуатации автомобильно-железнодорожного паромного комплекса
- Железнодорожный отдел
- Ремонтная группа путевого хозяйства
- Отдел технической эксплуатации
- Группа эксплуатации подъемно-переходного моста
- Ремонтная группа
Комплекс очистных сооружений
- Сборщик льяльных вод
- Станция комплексной переработки отходов
Группа транспортной безопасности и обеспечения охраны