Руководство
Лоцманская служба
Служба связи и электрорадионавигации
Система управления движением судов
Диспетчерская
Служба навигационно-гидрографического обеспечения
- Участок №1
- Участок №2
- Участок гидрографических работ
Отдел капитального строительства и ремонта
Отдел технической эксплуатации флота
Отдел информационных технологий и коммуникаций
Группа по охране труда и экологии
Группа обеспечения безопасности мореплавания
Группа организации портовой деятельности
Бухгалтерия
- Отдел учета
- Финансовый отдел
Планово-экономический отдел
Отдел имущества и арендных отношений
Тендерная группа
Юридический отдел
Отдел по работе с персоналом
Канцелярия
Служба обеспечения и транспорта
Группа безопасности
Сектор по МОБ и ГО
Режимно-секретное подразделение
Главный энергетик
Плавсостав